RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424927.5

C10orf90-204, Transcript of chromosome 10 open reading frame 90, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene C10orf90, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90-204ENST00000424927 TMOD3Q9NYL9 352 aa13.22□□□□□ -0.29
C10orf90-204ENST00000424927 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
C10orf90-204ENST00000424927 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
C10orf90-204ENST00000424927 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
C10orf90-204ENST00000424927 CABP4P57796 275 aa13.21□□□□□ -0.29
C10orf90-204ENST00000424927 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.21□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 SCN11AQ9UI33 1791 aa13.21□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 DCTN1Q14203 1278 aa13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 NFE2L2Q16236 605 aa13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 MCM10Q7L590 875 aa13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 PIGBQ92521 554 aa13.2□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 CCER2I3L3R5 266 aa13.19□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 RIPK4P57078 832 aa13.19□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 ERVV-2B6SEH9 535 aa13.18□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 APAF1O14727 1248 aa13.18□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 IL17REQ8NFR9 667 aa13.18□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 TEFQ10587 303 aa13.17□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 SLC52A2Q9HAB3 445 aa13.17□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 ASAP1Q9ULH1 1129 aa13.17□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 KCNQ4P56696 695 aa13.16□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.15□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa13.15□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 ATG3Q9NT62 314 aa13.15□□□□□ -0.3
C10orf90-204ENST00000424927 PALLDQ8WX93 1383 aa13.14□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 PLSCR1O15162 318 aa13.14□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 SLC39A6Q13433 755 aa13.14□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 TXNRD1Q16881 649 aa13.14□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 MRC1P22897 1456 aa13.13□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.13□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.13□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 BTBD11A6QL63 1104 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 PROM2Q8N271 834 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 LY75O60449 1722 aa13.12□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 RREB1Q92766 1687 aa13.11□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.11□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.11□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 KCNQ3O43525 872 aa13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 ATP6V1AP38606 617 aa13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 SIK1P57059 783 aa13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 PAPPAQ13219 1627 aa13.09□□□□□ -0.31
C10orf90-204ENST00000424927 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.08□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ZNF790Q6PG37 636 aa13.08□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 NBPF14Q5TI25 921 aa13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 C5P01031 1676 aa13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ITPK1Q13572 414 aa13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 SLC4A9Q96Q91 983 aa13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.07□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 HAX1O00165 279 aa13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ABCB7O75027 752 aa13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 WWC1Q8IX03 1113 aa13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 STK32BQ9NY57 414 aa13.06□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 UBR2Q8IWV8 1755 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 DNAJC10Q8IXB1 793 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 LINC00116Q8NCU8 138 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.05□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ZNF827Q17R98 1081 aa13.04□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 TJP1Q07157 1748 aa13.04□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 AK7Q96M32 723 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 C4BP0C0L5 1744 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 PHF14O94880 888 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 CCDC27Q2M243 656 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 SMIM5Q71RC9 77 aa13.03□□□□□ -0.32
C10orf90-204ENST00000424927 GNAI1P63096 354 aa13.02□□□□□ -0.33
C10orf90-204ENST00000424927 SLC15A2Q16348 729 aa13.02□□□□□ -0.33
C10orf90-204ENST00000424927 MBIPQ9NS73 344 aa13.02□□□□□ -0.33
C10orf90-204ENST00000424927 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
C10orf90-204ENST00000424927 CHL1O00533 1208 aa13.01□□□□□ -0.33
C10orf90-204ENST00000424927 GNPATO15228 680 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms