RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ATP7AQ04656 1500 aa21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 DCTPP1Q9H773 170 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 DDX11Q96FC9 970 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 INSRP06213 1382 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ATP2B1P20020 1258 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF521Q96K83 1311 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 VPS37DQ86XT2 251 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 CEP85Q6P2H3 762 aa21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 KINO60870 393 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 NPATQ14207 1427 aa21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ATP10AO60312 1499 aa21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ABCA8O94911 1581 aa21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 MYD88Q99836 296 aa21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-202ENST00000399336 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TNRQ92752 1358 aa21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD1Q15327 319 aa21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 IL13P35225 146 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TMX3Q96JJ7 454 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC192P0DO97 292 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 G2E3Q7L622 706 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TNMDQ9H2S6 317 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 HOMER1Q86YM7 354 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 EYA1Q99502 592 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 SNX21Q969T3 373 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ABCC1P33527 1531 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 SPATA32Q96LK8 384 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.8■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ME1P48163 572 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CAMK4Q16566 473 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ERICH2A1L162 156 aa21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 STK38Q15208 465 aa21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.77■■□□□ 1.08
NOMO3-202ENST00000399336 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 PIK3R4Q99570 1358 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 ERVK-7P63135 1459 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 ATP8B2P98198 1209 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 PPFIA3O75145 1194 aa21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 A0A087WZG4 1122 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 ZMYND15Q9H091 742 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 TPM2P07951 284 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 ZFYVE9O95405 1425 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 SLC39A6Q13433 755 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 USP25Q9UHP3 1055 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 HYPKQ9NX55 129 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 MTMR7Q9Y216 660 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 KRT32Q14532 448 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-202ENST00000399336 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms