RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 RIPK4P57078 832 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 NEUROD2Q15784 382 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 MCM10Q7L590 875 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 IL17REQ8NFR9 667 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 LY75O60449 1722 aa15.64■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 PAPPAQ13219 1627 aa15.63■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 PIGBQ92521 554 aa15.63■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 TEFQ10587 303 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 DCTN1Q14203 1278 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 FKBP8Q14318 412 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 RREB1Q92766 1687 aa15.62■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.61■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 PLSCR1O15162 318 aa15.6■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 PALLDQ8WX93 1383 aa15.59■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.59■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.58■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.58■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.58■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.58■□□□□ 0.09
C16orf46-201ENST00000299578 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.57■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 ATG3Q9NT62 314 aa15.57■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.57■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.57■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.56■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.56■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 C5P01031 1676 aa15.55■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 BTBD11A6QL63 1104 aa15.55■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 TXNRD1Q16881 649 aa15.55■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.55■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 SLC39A6Q13433 755 aa15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC27Q2M243 656 aa15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 PROM2Q8N271 834 aa15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.53■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 SIK1P57059 783 aa15.53■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF790Q6PG37 636 aa15.53■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 TJP1Q07157 1748 aa15.52■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 WWC1Q8IX03 1113 aa15.52■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 NGEFQ8N5V2 710 aa15.52■□□□□ 0.08
C16orf46-201ENST00000299578 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 KCNQ4P56696 695 aa15.51■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.51■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.51■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 KCNQ3O43525 872 aa15.5■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 ATP6V1AP38606 617 aa15.5■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.5■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 C4BP0C0L5 1744 aa15.5■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.49■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.49■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.49■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.48■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 CFAP44Q96MT7 982 aa15.48■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 IFT57Q9NWB7 429 aa15.48■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.48■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.48■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 CHL1O00533 1208 aa15.47■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 GNAI1P63096 354 aa15.47■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 ITPK1Q13572 414 aa15.47■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 IL16Q14005 1332 aa15.47■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF853P0CG23 659 aa15.46■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 WDR63Q8IWG1 891 aa15.46■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.46■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
C16orf46-201ENST00000299578 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.46■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.46■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF521Q96K83 1311 aa15.46■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.45■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 NBPF14Q5TI25 921 aa15.45■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 MBIPQ9NS73 344 aa15.45■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.44■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 STK32BQ9NY57 414 aa15.44■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF827Q17R98 1081 aa15.43■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 AKT1S1Q96B36 256 aa15.43■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 AK7Q96M32 723 aa15.43■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C16orf46-201ENST00000299578 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms