RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 MEIS3Q99687 375 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 IFT172Q9UG01 1749 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 HOXC9P31274 260 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CHL1O00533 1208 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 AK9Q5TCS8 1911 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 G2E3Q7L622 706 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 ANXA1P04083 346 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 USP6P35125 1406 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CBX1P83916 185 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 GNAI2P04899 355 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 FLIIQ13045 1269 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 BTBD11A6QL63 1104 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 GNAI3P08754 354 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 MPNDQ8N594 471 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CPS1P31327 1500 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 CDC45O75419 566 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 RABEP1Q15276 862 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 SBNO1A3KN83 1393 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB13-201ENST00000290295 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF853P0CG23 659 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 GCP02774 474 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 MED14O60244 1454 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 TSC1Q92574 1164 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 PTPRCP08575 1304 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 HSPA2P54652 639 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 SYCE3A1L190 88 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 GPT2Q8TD30 523 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 NBPF4Q96M43 638 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 DMTNQ08495 405 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 PKP1Q13835 747 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CHRNA2Q15822 529 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 RNF214Q8ND24 703 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 IGSF3O75054 1194 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 LGR6Q9HBX8 967 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 IL17REQ8NFR9 667 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 DLC1Q96QB1 1528 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 FAM177BA6PVY3 158 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 IP6K1Q92551 441 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 PTPRUQ92729 1446 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 ADGRB2O60241 1585 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 MYL6BP14649 208 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXB13-201ENST00000290295 KCNJ4P48050 445 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms