RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 AOX1Q06278 1338 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PDE1AP54750 535 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 MSH6P52701 1360 aa10.67□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 TPM3P06753 285 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PLCB2Q00722 1185 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 MEIS3Q99687 375 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 CLCN1P35523 988 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 KIF20BQ96Q89 1820 aa10.66□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHG5O94827 1062 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 TBX22Q9Y458 520 aa10.65□□□□□ -0.7
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.65□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NRDCO43847 1150 aa10.65□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.65□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 PDCP20941 246 aa10.65□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 RTL1A6NKG5 1358 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD1Q15327 319 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K5Q99683 1374 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 F6X3S4 739 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 SRGAP3O43295 1099 aa10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 METP08581 1390 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 FSD2A1L4K1 749 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 BTBD11A6QL63 1104 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 MCM5P33992 734 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 HS1BP3Q53T59 392 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 DRC7Q8IY82 874 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 MAP7D2Q96T17 732 aa10.63□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 SSH2Q76I76 1423 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 HOXB7P09629 217 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.62□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NLRP1Q9C000 1473 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 USP6P35125 1406 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TMX3Q96JJ7 454 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 EYA1Q99502 592 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 H3BQV1 296 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 IFFO2Q5TF58 517 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 PDRG1Q9NUG6 133 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ALDH1L1O75891 902 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 UVSSAQ2YD98 709 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 HYPKQ9NX55 129 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 TPM4P67936 248 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 FSD1Q9BTV5 496 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.6□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 HOXC9P31274 260 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 ZNF445P59923 1031 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 KRT32Q14532 448 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.59□□□□□ -0.71
HERC3-201ENST00000264345 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.7 ms