RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 LGR6Q9HBX8 967 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 BTAF1O14981 1849 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB4P16144 1822 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 BAG6P46379 1132 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGBQ92521 554 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF5Q96JK2 942 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 PROM2Q8N271 834 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-201ENST00000246533 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 CRBNQ96SW2 442 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17REQ8NFR9 667 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 PLSCR1O15162 318 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 RNMTO43148 476 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNQ4P56696 695 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K5Q99683 1374 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTN1Q14203 1278 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM2BQ8NHM5 1336 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-201ENST00000246533 CABP4P57796 275 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 DLG5Q8TDM6 1919 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MCM10Q7L590 875 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF521Q96K83 1311 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNRD1Q16881 649 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 PLIN1O60240 522 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 NEFMP07197 916 aa33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 NFE2L2Q16236 605 aa33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 NGEFQ8N5V2 710 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG3Q9NT62 314 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROD2Q15784 382 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP27Q5VZP5 1158 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 RUNDC1Q96C34 613 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA2Q08379 1002 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A6Q13433 755 aa33.59■■■□□ 2.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPK4P57078 832 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 LY75O60449 1722 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 APAF1O14727 1248 aa33.57■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
CAPNS1-201ENST00000246533 MRC1P22897 1456 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A9Q96Q91 983 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 TEFQ10587 303 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM161AQ3B820 660 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFN5Q08AF3 891 aa33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM35Q9UPQ4 493 aa33.51■■■□□ 2.96
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.51■■■□□ 2.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 SIK1P57059 783 aa33.51■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNQ3O43525 872 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf194Q5TEA3 1177 aa33.49■■■□□ 2.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.48■■■□□ 2.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF827Q17R98 1081 aa33.46■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD11A6QL63 1104 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1AP38606 617 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPPAQ13219 1627 aa33.45■■■□□ 2.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF790Q6PG37 636 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00116Q8NCU8 138 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
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