Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer3W4VSP1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer3W4VSP1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms