Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms