Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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