Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib1Q9Z0F4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cib1Q9Z0F4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib1Q9Z0F4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms