Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp1Q9WTX5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms