Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn7Q9R1S8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn7Q9R1S8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms