Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpk1Q9R0M5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpk1Q9R0M5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpk1Q9R0M5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpk1Q9R0M5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tpk1Q9R0M5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tpk1Q9R0M5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpk1Q9R0M5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tpk1Q9R0M5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms