Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms