Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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