Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp3Q9QY23 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms