Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms