Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmod4Q9JLH8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tmod4Q9JLH8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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