Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gde1Q9JL56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms