Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nova1Q9JKN6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nova1Q9JKN6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nova1Q9JKN6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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