Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Uchl3Q9JKB1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Uchl3Q9JKB1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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