Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3glb1Q9JK48 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms