Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms