Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pus3Q9JI38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms