Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tcirg1Q9JHF5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms