Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Aff4Q9ESC8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms