Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms