Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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