Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms