Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms