Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1fQ9DCQ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1fQ9DCQ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms