Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms