Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Med27Q9DB40 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Med27Q9DB40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms