Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms