Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph9Q9D9V4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms