Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms