Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms