Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Srp19Q9D7A6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Srp19Q9D7A6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Srp19Q9D7A6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srp19Q9D7A6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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