Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms