Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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