Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms