Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clvs1Q9D4C9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clvs1Q9D4C9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms