Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc25Q9D4B2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc25Q9D4B2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc25Q9D4B2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc25Q9D4B2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc25Q9D4B2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc25Q9D4B2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc25Q9D4B2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc25Q9D4B2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc25Q9D4B2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc25Q9D4B2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc25Q9D4B2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc25Q9D4B2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms