Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms