Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpn3Q9D3W4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms