Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms