Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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