Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc6bQ9D289 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc6bQ9D289 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc6bQ9D289 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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