Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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