Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3eQ9CZT4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms